@MASTERSTHESIS{ 2021:1931118909, title = {Transcriptoma integrativo de células humanas tratadas com diferentes tipos de nanopartículas}, year = {2021}, url = "https://bdtd.unifal-mg.edu.br:8443/handle/tede/1757", abstract = "Nanopartículas (NPs) são partículas que possuem tamanho inferior a 100 nM. As NPs podem ser produzidas de diversos materiais orgânicos e inorgânicos e em diversas formas (por exemplo nanotubos, nanoesferas e nanobastões). Esta tecnologia apresenta potencial promissor para várias aplicações biológicas tendo em vista a sua possibilidade de funcionalização, o que permite o seu direcionamento seletivo para órgãos, tecidos e células. A aplicabilidade na saúde humana está relacionada ao uso das NPs como estimuladores do sistema imune quando conjugados com antígenos, no uso para o diagnóstico e tratamento de tumores e para a entrega de medicamentos em determinados tecidos e órgãos. Apesar do uso das NPs em novos sistemas de diagnóstico, tratamento ou prevenção para doenças humanas, poucos estudos são realizados para verificar o efeito das NPs sobre o transcriptoma celular. A análise integrativa de transcriptoma (ITA) é atualmente reconhecida como uma técnica promissora para a compreensão de eventos biológicos a partir da análise de diversos transcriptomas depositados em bancos de dados públicos. Essa abordagem permite não só avaliar quais genes são diferentemente expressos nas diversas condições, mas também é capaz de inferir sobre suas as respectivas vias biológicas ativadas após um determinado estímulo. Nessa pesquisa foram identificados 81 transcriptomas derivados de células humanas tratadas com NPs no banco de dados Gene Expression Omnibus (GEO). Destes, 45 foram selecionados por serem transcriptomas de células tratadas com NPs compostas apenas de um material (sem associação ou conjugação com nenhuma outra substância ou material) e células não tratadas. Os demais foram excluídos por terem dados incompletos, não terem sido realizados em duplicatas, falta de grupo controle, e por serem de dados derivados de células tratadas com NPs composta por mais de um material. Assim sendo, devido a variabilidade desses estudos, somente foram selecionados transcriptomas de células tratadas com NPs por 24 horas. Dessa forma, foram utilizados 30 conjuntos de dados que compreendem transcriptomas derivados de 5 materiais e 6 células diferentes. A ITA utilizou os genes diferencialmente expressos (DEGs) identificados em cada um dos transcriptomas e demonstrou que existe uma especificidade na resposta celular aos diferentes tipos de NPs. Poucos DEGs apresentaram expressão em comum à dois ou mais transcriptomas analisados. A análise de vias biológicas apresentou uma diversidade de vias ativadas e suprimidas pelos diferentes tratamentos com poucas vias compartilhadas entre os diferentes transcriptomas analisados. Portanto, a ITA de células humanas tratadas com diferentes tipos de NPs demonstra uma resposta transcricional específica e dependente do tipo de material utilizado na nanopartícula e do tipo celular.", publisher = {Universidade Federal de Alfenas}, scholl = {Programa de Pós-graduação em Ciências Biológicas}, note = {Instituto de Ciências da Natureza} }