@MASTERSTHESIS{ 2023:875790613,
 	title = {Bioisosterismo aplicado para execução de ancoragem molecular contra alvos essenciais do SARS-CoV-2},
 	year = {2023},
 	url = "https://bdtd.unifal-mg.edu.br:8443/handle/tede/2325",
 	abstract = "As cisteíno proteases do SARS-CoV-2, nomeadamente protease principal (Mpro) e papaína
 (PLpro), são proteínas não-estruturais essenciais devido ao papel que elas possuem na formação
 do complexo múltiplo enzimático de replicação-transcrição deste microrganismo. Por esse
 motivo, estas enzimas são alvos extremamente relevantes no âmbito do desenvolvimento de um
 novo candidato a fármaco que atue no combate à COVID-19. Neste sentido, até o presente
 momento, o nirmatrelvir é o único fármaco que atua como inibidor covalente de Mpro aprovado
 por agências reguladoras ao redor do mundo para uso emergencial. Além dele, um segundo
 fármaco que atua como inibidor não covalente de Mpro, nomeadamente ensitrelvir, foi aprovado
 para uso emergencial em solos japoneses. Entretanto, uma recente pesquisa publicada por
 Iketani e colaboradores no início de novembro de 2022, defende que o SARS-CoV-2 pode já
 ter adquirido resistência tanto ao nirmatrelvir quanto ao ensitrelvir através de várias vias
 evidenciadas mediante estudos in vitro. Isto posto, pautado pela estratégia do bioisosterismo, o
 presente trabalho selecionou 126 de um total de 1050 ligantes do banco de dados do DrugBank.
 Os ligantes escolhidos foram fármacos tanto já aprovados por agências reguladoras quanto em
 fase de investigações clínicas. Em seguida, 831 derivados por bioisosterismo, alguns dos quais
 tiveram suas estruturas simplificadas, foram concebidos utilizando-se o software MB-Isoster.
 Ademais, com base em resultados de IC50 obtidos a partir de experimentos in vitro de outros
 pesquisadores, tanto para a Mpro quanto para a PLpro
 
 , 2 ligantes-controle pertencentes à
 subclasse de inibidores não covalentes foram escolhidos para cada alvo. Estados de ionização
 em pH 7,4 foram considerados para todas as moléculas, assim como para as enzimas, e, a seguir,
 estudos de ancoragem molecular foram conduzidos mediante uso do software AutoDock Vina.
 
 Os resultados dos derivados mais promissores, assim como dos seus precursores e dos ligantes-
 controle, foram analisados utilizando-se os softwares Pymol e Discovery Studio. Por fim, um
 
 estudo das propriedades físico-químicas, bem como de aspectos de drogabilidade, tais como
 alertas estruturais e acessibilidade sintética, e de ADMET, foram efetuados através das
 plataformas SwissADME e ADMETlab 2.0. Os resultados promissores obtidos com as
 moléculas DB00549_BI_005, DB04868_BI_003, DB11984_BI_002, DB12364_BI_006 e
 DB12805_BI_004 devem ser ratificados por estudos de dinâmica molecular, seguidos de
 ensaios empíricos in vitro e in vivo que ratifiquem os resultados defendidos in silico.",
 	publisher = {Universidade Federal de Alfenas},
 	scholl = {Programa de Pós-Graduação em Química},
 	note = {Instituto de Química}
}